Jesuskirken i Valby blev bygget af brygger Carl Jacobsen, som ønskede “at bygge en kirke i Valby, som i skønhed skulle overgå alle andre kirker i København”. Inspirationen til kirkens udformning havde han allerede som ung fået fra kirkerne i Sydeuropa, især i Ravenna.

Inspirationen til kirkens hovedorgel (over alteret) fik han derimod på nogle af sine mange rejser til Paris, hvor kirkerne genlød af klangen fra de nye orgler bygget af Aristide Cavaillé-Coll. Siden 1840’erne havde Cavaillé-Coll bygget orgler til flere af de store kirker, bl.a. Notre Dame, Saint Sulpice og Madeleine-kirken og havde gennem nytænkning og høj kvalitet skabt sig et navn som ingen anden i sin samtid. Cavaillé-Coll-orglerne fandtes efterhånden i store dele af Frankrig, men også i øvrige dele af Europa samt i Sydamerika, USA, Nordafrika og Kina!

Det har derfor været oplagt for Carl Jacobsen at vælge verdens førende orgelbygger til Jesuskirken og dermed bringe Nordens eneste Cavaillé-Coll-orgel til Valby.

I dag er Jesuskirkens hovedorgel berømt i orgelkredse i Danmark. Men også i Skandinavien og i orgelkredse i resten af Europa kender man det fine instrument, som er et af Cavaillé-Colls mest vellykkede mindre orgler og i dag står næsten intakt fra opstillingen d. 6. september 1890. Orglet har 20 stemmer fordelt på Grand Orgue, Récit og Pédale.

Orglets disposition er:
GRAND-ORGUE: Bourdon 16', Montre 8', Flûte harmonique 8', Bourdon 8', Salicional 8', Prestant 4', Flûte douce 4', Plein-jeu IV.
RÉCIT: Flûte traversière 8', Viole de gambe 8', Voix céleste 8'*, Flûte octaviante 4', Octavin 2', Basson-Hautbois 8', Trompette harmonique 8', Clairon harmonique 4'.
PÉDALE: Soubasse 16', Basse 8', Bourdon 8', Bombarde 16'.
Grand-Orgue et Récit – 56 notes, Pédale – 30 notes
Tirasse Grand-Orgue, Tirasse Récit, Copula Récit/Grand-Orgue
Pédale d’expression du Récit ; Pédale d’orage
Appel/Renvoi fonds Grand-Orgue: Montre 8', Prestant 4' et Plein-jeu IV
Appel/Renvoi anches Récit: Trompette harmonique 8' et Clairon harmonique 4'
*) Voix céleste 8' blev fjernet i 1928 og erstattet af en Bourdon 8' – men blev i 1963 rekonstrueret af Poul-Gerhard Andersen og igen i 2018 af Denis Lacorre; orglet blev senest restaureret af Denis Lacorre i 2018 med velvillig støtte fra Johan Otto Wroblewskis Fond.

I anledning af 125-året for Cavaillé-Coll-orglet i 2015 indspillede kirkens organist, Sven Verner Olsen, en CD med Widors 5. og 6. orgelsymfonier. CD'en kan købes i kirken eller på organistens hjemmeside http://organistolsen.dk/

Over udgangsdøren - dvs over "Apostelvæggen" - står "Apostelorglet", som er bygget af Jensen & Thomsen og blev leveret til kirken 1993. 2 stemmer (**) med pibemateriale fra Garnisons Kirke blev indsat i 1994. Orglet er bygget i syd-/mellemtysk barokstil og har 16 stemmer plus 3 transmissioner (*).

HV:
Bordun 16'
Principal 8'
Spidsfløjte 8'
Oktav 4'
Superoktav 2'
Mixtur IV
Cornet V (D)
Trompet 8' (B/D)

PED:
Principalbas 16'
Oktavbas 8'*
Oktavbas 4'*
Basun 16' **
Trompet 8'*

POS:
Bordun 8'
Quintadena 8' ** (fra c)
Fløjte 4'
Tværfløjte 2'
Quint 1 1/3'
Vox humana 8' (B/D)

 

Omfang: C-g3; C-f1.
Registerdeling: h/c1. Kopler: POS-HV, HV-PED. Kanaltremulant for hele orglet. Temperering: Valotti. Dobbelt faltebælg. Mekanisk traktur og registratur; sløjfevindlader.

 

På gulvet overfor prædikestolen står kirkens lille kororgel, som formentlig er bygget af Jens Gregersen o. 1860. Det har 3 stemmer og blev opstillet i Jesuskirken i 2004.